Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Garnl3Q3V0G7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms