Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd42Q3V096 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd42Q3V096 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms