Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E330034G19RikQ3UWX6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms