Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr1d1Q3UV55 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms