Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3USZ8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3USZ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3USZ8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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