Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW5

Foxred2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxred2Q3USW5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxred2Q3USW5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxred2Q3USW5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms