Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms