Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1lQ3USQ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1lQ3USQ7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1lQ3USQ7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1lQ3USQ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1lQ3USQ7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1lQ3USQ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1lQ3USQ7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1lQ3USQ7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1lQ3USQ7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1lQ3USQ7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms