Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms