Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TceancQ3US16 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms