Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc4Q3UP44 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms