Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrch2Q3UMG5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrch2Q3UMG5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrch2Q3UMG5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrch2Q3UMG5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lrch2Q3UMG5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrch2Q3UMG5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrch2Q3UMG5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrch2Q3UMG5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrch2Q3UMG5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrch2Q3UMG5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrch2Q3UMG5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms