Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330014E10RikQ3UL33 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms