Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp19Q3UJD6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms