Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc34Q3UI66 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms