Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx27Q3UHD6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms