Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc177Q3UHB8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms