Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgef3Q3UGY8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms