Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnft2Q3UF64 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms