Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U6N9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U6N9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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