Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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