Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hvcn1Q3U2S8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms