Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pip4p1Q3TWL2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pip4p1Q3TWL2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pip4p1Q3TWL2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pip4p1Q3TWL2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pip4p1Q3TWL2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pip4p1Q3TWL2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pip4p1Q3TWL2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms