Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tamm41Q3TUH1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms