Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c3Q3TMP1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms