Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde12Q3TIU4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde12Q3TIU4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde12Q3TIU4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde12Q3TIU4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde12Q3TIU4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde12Q3TIU4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde12Q3TIU4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde12Q3TIU4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde12Q3TIU4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde12Q3TIU4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde12Q3TIU4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde12Q3TIU4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms