Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc13Q3TIR1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms