Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jmjd8Q3TA59 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jmjd8Q3TA59 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms