Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm1123Q1RME4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm1123Q1RME4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms