Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myo3bQ1EG27 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myo3bQ1EG27 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myo3bQ1EG27 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Myo3bQ1EG27 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myo3bQ1EG27 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myo3bQ1EG27 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myo3bQ1EG27 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Myo3bQ1EG27 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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