Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd3Q14AI6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rpusd3Q14AI6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rpusd3Q14AI6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rpusd3Q14AI6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rpusd3Q14AI6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd3Q14AI6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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