Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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VgfQ0VGU4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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VgfQ0VGU4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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VgfQ0VGU4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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VgfQ0VGU4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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VgfQ0VGU4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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VgfQ0VGU4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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VgfQ0VGU4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VgfQ0VGU4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms