Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne7Q0VE82 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms