Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntnap5bQ0V8T8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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