Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm1Q0GA42 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms