Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms