Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms