Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ssrp1Q08943 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssrp1Q08943 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms