Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms