Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pou6f1Q07916 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms