Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ebf1Q07802 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ebf1Q07802 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms