Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col17a1Q07563 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms