Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nfe2Q07279 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms