Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms