Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms