Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a1Q05722 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a1Q05722 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms