Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms