Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox10Q04888 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox10Q04888 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox10Q04888 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox10Q04888 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox10Q04888 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox10Q04888 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox10Q04888 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox10Q04888 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox10Q04888 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox10Q04888 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox10Q04888 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms