Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms