Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms